公開メモ DXM 1977 ヒストリエ

切り取りダイジェストは再掲。新記事はたまに再開。裏表紙書きは過去記事の余白リサイクル。

KININARU研究 OceanDNA MAGカタログ

2022-06-20 11:33:00 | 地球環境

聞きなれない微生物ダークマターとは


生物系統不明の、未知な微生物であり、宇宙に存在する未知の暗黒物質(ダークマター)に例えられる。海洋には、多くの微生物ダークマターが存在すると考えられる。


「Scientific Data」(6月17日付)

論文タイトル:

The OceanDNA MAG catalog contains over 50,000 prokaryotic genomes originated from various marine environments 

著者:

Yosuke Nishimura*, Susumu Yoshizawa

  • 膨大なメタゲノムデータから高い品質で個々の微生物のゲノムを解読する手法を新たに開発しました。
  • 開発した手法を大規模な海洋メタゲノムデータ(約29兆塩基対)に適用した結果、59門にまたがる5万以上の原核生物ゲノムの解読に成功し、解読されたゲノムには新綱相当のものを含む、高い新規性が見出されました。
  • 得られたゲノム情報を、世界最大の海洋微生物ゲノムカタログ「OceanDNA MAGカタログ」として公開しました。
  • 本研究は、「微生物ダークマター」に相当するゲノムを多数解読することで、海洋微生物の知られざる多様性を解明しました。OceanDNA MAGカタログは、海洋生態系を理解し、さらには地球環境変動の要因解明や予測のための重要な情報基盤となります。
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