- 宇佐市
- 佐田城 [サダジョウ] ◆市指定
- 光岡城 [ミツオカジョウ] ◆県指定
- 臼杵市
- 臼杵城 [ウスキジョウ] ＜続100名城＞ ◆県指定
- 杵築市
- 杵築城 [キツキジョウ]
- 玖珠郡
- 玖珠城 [クスジョウ]
- 角牟礼城 [ツノムレジョウ] ＜続100名城＞ ◆国指定
- 森陣屋 [モリジンヤ] ◆県指定
- 国東市
- 吉広城 [ヨシヒロジョウ]
- 佐伯市
- 小田山城 [コダヤマジョウ]
- 佐伯城 [サイキジョウ] ＜続100名城＞ ◆国指定
- 栂牟礼城 [トガムレジョウ] ◆市指定
- 速見郡
- 日出城 [ヒジジョウ] ◆町指定
- 大分市
- 大友氏館 [オオトモシヤカタ] ◆国指定
- 高崎山城 [タカサキサンジョウ]
- 鶴賀城 [ツルガジョウ]
- 府内城 [フナイジョウ] ＜100名城＞
- 竹田市
- 岡城 [オカジョウ] ＜100名城＞ ◆国指定
- 南山城 [ナンザンジョウ] ◆市指定
- 山野城 [ヤマノジョウ] ◆市指定
- 中津市
- 長岩城 [ナガイワジョウ] ◆県指定
- 中津城 [ナカツジョウ] ＜続100名城＞ ◆市指定
- 一ツ戸城 [ヒトツドジョウ] ◆市指定
- 平田城 [ヒラタジョウ] ◆市指定
- 日田市
- 永山城 [ナガヤマジョウ] ◆県指定
- 日隈城 [ヒノクマジョウ]
- 星隈城 [ホシクマジョウ]
- 豊後高田市
- 鞍懸城 [クラカケジョウ]
- 屋山城 [ヤヤマジョウ]
- 豊後大野市
- 鎧岳城 [ヨロイダケジョウ]
