駅降り：都営三田線（巣鴨－神保町）

巣鴨は島式、改札内コンコースは２ヶ所ある。JRに近い南側改札内コンコースの改札口は利用客が多いので改札、出札分離されている。出口は東西２ヶ所、JRへの乗換えは東側で、出口はJR駅舎と上屋がつながっている。北側改札内コンコースには地蔵文庫という貸本コーナー、監視カメラのためか回収率は良さそうである。

千石は島式、ホーム、コンコースともに天井は剥き出しで殺風景である。２ヶ所の改札内コンコースに対し、改札外コンコースは１ヶ所だが、両改札の間は仮囲いが入り組んでいるのでわかりにくい。出口は両方の改札付近から２ヶ所ずつ、その中間地点にエレベーター専用出口がある。それを除いた４ヶ所の出口は低層ビルの１階にある。

三田線は広い白山通りから離れて走るようになる。白山はカーブ上にある相対式、支柱がない珍しい構造である。コンコースは１ヶ所、それに対する改札は南北２ヶ所ある。コンコースは天井剥き出しで防火工事をやっているようである。北コンコースからは２ヶ所の出口に出られ、南コンコースからは長い通路を挟んで１ヶ所の出口に出られる。３ヶ所とも単独出口である。

春日は相対式、それぞれのホームの両端に改札があり、両ホームは改札内通路で結ばれている。改札１ヶ所につき出口は１ヶ所なので計４ヶ所、改札から出口までの通路は少し入り組んでいる。水道橋寄り改札付近には、大江戸線乗換えコンコースへ降りる階段がある。丸の内線の高架の向こうには後楽園遊園地のジェットコースターが見える。次の水道橋はその先にある。

水道橋は島式、改札内コンコースは南北２ヶ所ある。出口は西４ヶ所、東２ヶ所の計６ヶ所、西の出口は後楽園遊園地の横に分布、単独出口で北側２ヶ所は比較的小さい。JRへの乗換えは、南側の西の出口、外堀通りを横断して神田川を渡らなければならない。

都営新宿線をアンダークロスすると、島式の神保町に到着する。都営新宿線ホームは相対式なので、ホーム別に階段を上がることになる。改札外コンコースは都営新宿線ホームで遮られており、南の方は２ヶ所の改札内コンコースにつながる。南コンコースからの出口は４ヶ所、北コンコースからの出口は３ヶ所で、靖国通りとの交差点周辺に分布している。