南大東島には村立の南大東小学校、南大東中学校があり、併設された南大東幼稚園もある。校舎は池之沢集落の外れにあり、１９２３年からこの場所で学校教育が継続されてきた（学校教育はそれよりも前に別の場所で行われていた）。島内には高等学校が設置されていないため、中学校を卒業するとほぼ全員が那覇の高等学校に進学している。少年少女が勉学のため故郷を離れ、新天地で生活するのは切ない思いがある。このような故郷を離れなければならない少女の心情を描いた「旅立ちの島唄～十五の春」という映画が制作された。監督は吉田康弘で、２０１３年に公開された。船便しかなく、通信手段は内地と違って大幅に到着が遅れる手紙しかなかった時代では、さぞかし心細かったのではなかろうか。しかし、昨今では空路が日常的に利用でき、電話、インターネットなどの情報伝達方法が発達したため、島を離れても昔ほど大きな感慨を持つことはないであろう。
一段目の写真は正門であり、幼稚園に３歳から通うとなれば１２年間はこの正門を通過することになる。正門の前の道路には島唯一の交通信号機が設置してあり、離島の信号機は珍しいので、旅行記やブログなどでは必ず紹介されている。
二段目の写真は小学校の校舎であり、写ってはいないが左側には中学校の校舎がある。南大東小学校の全生徒は８７名、南大東中学校の全生徒は３６名であり、合計１２３名が在学している（２０２２年度）。
三段目の写真は小中学校共通の屋内運動場で、２０２１年に竣工したので私が訪問した時はピカピカの新しい建物であった。手前が運動場であるが、生徒数に比べて遙に広い。これだけ広いのには歴史的な理由がある。南大東村誌から拾った、各年代における学校の敷地面積と生徒数は次のようになる。
敷地面積 生徒数
１９０３年 寺子屋式の私塾の開始 ３２名
１９０９年 １４９名
１９１５年 ３４６名
１９１６年 ３５８名
１９２５年 １３５９６平米
（運動場は１０２９６平米）
１９２７年 ６００名
１９３２年 ２０３４８平米
（運動場を６７５２平米拡張する）
１９３３年 ７３８名
１９４４年 ７２５名
１９４５年 ２４７名
１９７３年 ５３６名（小中）
１９８５年 ３３９４８平米 ２３３名（小中）
２０２３年 ４２１７１平米 １２３名（小中）
（戦前の生徒数は尋常科のみか高等科も含めたのか不明、戦後は小中学生）
１９１５年から１９７３年の間は尋常小学校、中学校の卒業生数しか統計が無く、この間の在籍生徒数は不明である。１９８５年以降は在籍生徒数の記録が残っているが、１９４５年から１９８４年の間で記録が残っているのは１９７３年だけである。１９７３年の在籍生徒数は５３６名であったが、この数値が戦後最大の在籍生徒数であったとは思われず、実際にはもっと多い時期があったと考えれる。
村の人口が最大であった年度は１９６０年で、３５１３人を記録している。１９７３年の人口は１８７９人に減少している。全生徒の数が全住民の人数と比例すると仮定するなら、１９６０年の在籍生徒数は１９７３年に比べて８６％も多かったことになり、１千人を越えるマンモス校であったことになる。これだけ多人数の生徒を収容するためには、この広さの運動場が必要であった。現在の運動場が全生徒数に比べて広大なのは、島が砂糖産業が好況で、島には生徒が多く居住していた時代の名残なのである。
なお、２０２３年に役場が発表した村勢要覧によれば、学校の敷地面積が増加している。数年前、今後の教育施設の拡張のため、三段目の写真にある屋内運動場の左側の砂糖きび畑を買収したからである。
四段目の写真は小学校の脇に併設された南大東幼稚園であり、２０２２年度で４歳児、５歳児合わせて３２人を預かっている。２０２３年度からは２歳児も預かる、と告知している。また、幼稚園の他に、村役場のそばには保育園があり、こちらでは１歳半児から預かっていて、２０２２年度は３５名の園児が在籍している。都会で問題となっている待機児童はおらず、育児については島では至れり尽くせりである。