ゲノムのN50 size 2009-04-07 17:11:26 | バイオインフォマティクス 論文を読んでいてゲノムのN50 sizeって何だろう?と調べてみると アセンブルされたゲノムの長さのうち50%が、その長さのブロックか、それより長いブロックに属している。という指標ということらしい。 ニワトリだと、以下のような例があった。 contigs: N50 = 45kb (n=5863); longest contig = 625kb 長ければ長いほど良いのだろう。 図で描くとこんな感じか。 « TomcatがShutdownできない問題 | トップ | Fisherの正確確率検定 »
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