正確な原因は分かりませんが、ネットを調べるとやはりインストールしたプログラムを疑うのが、良さそうです。GitHubを弄っては居るものの、まさかAtomと相性が悪いことはないでしょう。
もう一つSauceツリ-というものを、分からずにインストールしてそのままにしてました。のでアンインストールしました。でも無理かと思いましたが、Atomを起動してみました。驚くなかれ、正常に起動しました。
一時はWindowsImageBackupから戻さないといけないかもしれないと、思ってましたので取り敢えずは安心しました。イメージから復元するときには、復元ポイントからの復元よりは、大掛かりになりそうですし、手軽ではないです。復元ディスクから起動しないと出来ないようですし、選択を間違えて、HDDをフォーマットしてしまうと、データも失います。今の時点で復元ポイントを作っておいた方が良いのかもしれません。
GitHubはなかなか難しいです。いったん出来れば楽なのでしょうかね。ゴールはまだ先のようです。