WordPressとホームページの関係は？

自分でもワードプレスブログのブログを作っていますが、それとPHPなどの関係が分かってません。PHPはHTMLのファイルに直接書くことが出来るはず。でもワードプレスブログではどうするのか？今回スターサーバを使ってみてますが、ワードプレスブログに組み込むことは出来ないのかもしれません。その他にもう一個普通のブログ、試験サイトも出来ました。

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上の方がhtmlで下がブラウザの表示です。

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よく見るのは上のファイルで直接PHPのコードを書き込めるはずです。