家の庭で品種改良!

庭でみかんの品種改良やってます

Gephiで家系図

2022年05月30日 22時49分29秒 | カンキツ

毎月、月末になると振り返りみたいなのをやっているんですが、今月、というか今年はなんかダメですね笑

 

カンキツの接ぎ木も毎年はなんてことなくうまくいっているにもかかわらず今年は成功率2割以下

今年発芽した変異体もほとんど枯らしてしまっています

植物はシーズンを逃すと一年間待たないといけないのがしんどいですね、、

パソコンなんかいじってないでもっと僕たちのことかまってよ~という声が聞こえてきそうです笑

 

さて、そうはいいつつ、最近パソコンにハマっているのは確かで、今日はずっとやりたかったGephiでの家系図づくりをしました。

Gephiというのはネットワークをうまいこと視覚化してくれるソフトで、

ネットワークで中心になっているものを強調してくれたりする機能がついています。

ずっとこのGephiを使ってカンキツの家系図を作ってみたかったのですが、日本語で書かれた説明書がなかったので躊躇していました。

院試の関係で英語もだいぶ慣れてきたので今回やっとのことで作ってみました

ひとまずお試しで作っただけなので、かなり系統関係にはミスがあると思いますし、

全然品種数が少ないですが、徐々に直していこうと思うのであまり気にしないでください。

 

系統関係の近い品種同士をなるべく近くに配置しています。

こう見るとやはり清見、アンコール、ポンカンあたりが良く親に使われていることがわかりますね

 

まだまだ機能が加えられそうなので、系統関係のミスを直しつつ、もっと見やすいグラフを目指していきます♪

 

系統関係参考元↓

清見ファミリー系譜図 - 家の庭で品種改良! (goo.ne.jp)