一般的に卵巣チョコレート嚢胞の再発は取り残しによるものと考えられている。しかし、術後、排卵により新たにチョコレート嚢胞が形成されてくることによる再発もあるのだろう。
もし、ほぼ切除したと思っていた症例でごくわずかに取り残した子宮内膜症病変が再びチョコレート嚢胞になるのであれば、少なくとも再発までに３～４年はかかるのではないかと思う。しかし、実際には術後早期にチョコレート嚢胞が再発していることも珍しくない。おそらく、排卵することにより、いとも簡単に新たなチョコレート嚢胞ができてしまうのではないだろうか？
卵巣チョコレート嚢胞を核出する際にもっとも注意しなければならないのは、子宮内膜症病変を取り残さないこと、そして正常卵巣組織を傷つけないことである。
もし、卵巣血管を傷ついて過度に凝固止血（もしくは縫合）した結果、卵巣血流が低下して卵巣機能不全を起こした場合、その卵巣は排卵障害になるだろう。
もし、チョコレート嚢胞がきれいに核出でき、卵巣自体はほとんど傷つかなかった場合、卵巣機能は正常だろうし術後もどんどん排卵するだろう。
ということは、きれいに手術できた場合には、何度も排卵して、すぐに再発してしまい、雑に手術して卵巣の血流を低下させてしまった場合には、全然排卵できないので、あまり再発しない…のだろうか
