ご注意： 2021 年 2 月における R 4.0.4 での話ではありませんから。
RStudio Version 1.1.456 を立ち上げると，
During startup - Warning messages:
1: Setting LC_CTYPE failed, using "C"
2: Setting LC_COLLATE failed, using "C"
3: Setting LC_TIME failed, using "C"
4: Setting LC_MESSAGES failed, using "C"
5: Setting LC_MONETARY failed, using "C"
と出て，案の定，日本語を含むプログラムを読み込むと，文字化けしている。
もう，これは他のことで経験済みなので，慌てることなく
Sys.setlocale("LC_ALL", "ja_JP.UTF-8")
とやって，問題なし。
pythontex は，望み薄かな？
実装が古いのと，日本語化の関連で，ちょっと面倒くさいというか無理っぽい。
やっぱ，R と Sweave の組み合わせが最強。
そのまんまでは，入力と出力のフォーマットに全く違いがない。ので，まぎらわしい。
Sweave のようには行かず，インタラクティブモードのように，入力の前にプロンプトがつくようにはできないようだ。
そこで，LaTeX の listings を使う。
listings.sty と jlisting.sty を用意して，プリアンブルで以下を定義しておく。
\usepackage{listings,jlisting}
\lstset{%
basicstyle={\ttfamily\normalsize},%
frame={tbrl},
numbers=left,%
xleftmargin=3zw,%
lineskip=-0.5ex%
}
これだけではだめで，
/usr/local/lib/python3.6/site-packages/pweave/formatters/tex.py
の，initformat の赤字部分を以下のように変更する。
def initformat(self):
self.formatdict = dict(codestart='\\begin{lstlisting}',
codeend='\\end{lstlisting}',
outputstart='\\begin{quote}\n\\begin{verbatim}',
outputend='\\end{verbatim}\n\\end{quote}',
figfmt='.pdf',
width='\\linewidth',
doctype='tex')
これで
<<>>=
x = 2
y = 4
print(x-y)
@
が，
のようなイメージで表示される。
すなわち，プログラム〔入力〕が行番号付きで，出力は行番号なしで出力される。
\color{} を使って，入力と出力を分けることもできるけど，色を使うのは避けたい。
TeXShop の engines フォルダを見たら，pythontex というのがあった。
ちょっと，調べてみる。
なんとなれば，Psweave は 入力に対する出力はまとめられてしまうからなあ。
そのほかの不都合は前述の通り。
Sweave engine の最初の部分だけを以下のように変更して使う。
mp = function(file, makeindex=FALSE, silent=FALSE, deletePdfs=FALSE, deleteWorkfiles=FALSE, ...) {
Sys.setlocale("LC_ALL", "ja_JP.UTF-8")
if (grepl("\\.", file) == FALSE) {
file = paste(file, "Rnw", sep=".")
}
cat("Input file:", file, "\n")
cmd = sprintf("pweave -f tex %s", file)
system(cmd)
base = sub(".Rnw", "", file)
:
R のための Sweave と同じような感じで，python のための Pweave（http://mpastell.com/pweave/) を使ってみる。
以下で，全角の ＜，＞ は，実際は半角で
TeXShop を使って，*.Pnw --> *.tex ---> *.pdf の操作を行うにあたって，大問題がある。
それは，TeXShop は .Pnw などという拡張子を認識しないということである（.Rnw は認識するのに）。
仕方ないから，.Rnw を流用することにするが，何とかならないか？
● チャンクの記述法
もう一つの問題点。
コマンドラインでは ```pythpn 〜 ``` が有効で，＜＜＞＞= 〜 @ はだめ。
TeXShop では全く逆。```pythpn 〜 ``` がだめで，＜＜＞＞= 〜 @ が有効。
次の 3 つの例は，だめ。
(1)
```python
a = 12
b = 34
print(a+b)
```
(2)
オプションを定義することもできる
```python, echo=False
a = 12
b = 34
print(a+b)
```
図を挿入する方法
```python
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
x = np.linspace(0, 2*np.pi)
plt.plot(x, np.sin(x))
```
\bigskip
次の 2 つの例は有効。
＜＜fig = True, width = '12 cm', echo = True＞＞=
from pylab import *
plot(arange(10))
show()
@
＜＜＞＞=
x = 2
y = 4
print(x-y)
@
● インラインコード
コードをその場で評価する sqrt(8)= ＜% np.sqrt(8) %＞
8 の平方根を，この後へ挿入 sqrt(8)=2.8284271247461903
式を評価した結果を出力する sqrt(8)=＜%= np.sqrt(8) %＞
8 の平方根を，この後へ挿入 sqrt(8)=2.8284271247461903
違いはないようにみえるのだが？
