遺伝屋ブログ

酒とカメラとアウトドアの好きな大学研究者です。遺伝学で飯食ってます(最近ちょっと生化学教えてます)。

先見の明の問題

2009-11-20 22:56:49 | BIONEWS
消化器系がんを9割検出 金沢大グループが新技術(共同通信) - goo ニュース
今日はちょっとこの研究室の知り合いに電話する用事があったのですが、このビッグニュースが流れたので遠慮しました。んなわけで、今日はこのニュースのお話をせななりますまい(といっても、別に内情を知ってる訳でもなんでもないのですよ)。
この仕事は第一内科の金子先生の研究室のお仕事でして、10年くらい前からスタートしていたプロジェクトだったはずです。DNAチップを使った癌診断は、この技術が生まれたときから世界中で目指されていたものでして、多額の資金と多くの研究者・技術者が投入されて熾烈な競争がなされてきました。しかし、これといって画期的な方法が何年もの間出てきてなかったんですよ。正直言って、僕はこの技術は役に立たずに廃れていく可能性さえあると思ってました。相変わらず、私ゃ、先見の明がありませんな。DNAチップというのは下の図でイメージしていただけたらありがたいんですけども・・・・難しいですね。

ヒト遺伝子の配列を持たせた短いDNAを一個ずつガラスプレートに固定して、その遺伝子の発現の変化を検知できるようにしたシステムなんです。測定しているのは、あくまでも変化でして、絶対量じゃないです。変化を検知するので、何から変化したかの基準のサンプルが大切です。パラメーターとなる遺伝子の数がヒトゲノムの『全部』からスタートして絞り込むんだけど、今回の仕事では約800くらいに絞り込んだそうな。この800の遺伝子がどう変わればどの臓器に癌ができたか推定するための演算というか・・・アルゴリズムというか・・・順列と組み合わせというか・・・そこらへんが肝なんでしょうな。それと重要なポイントは、血液というとっても採りやすいサンプルで検査を可能にしたということでしょう。
特許申請中ということですので実用化はまだちょっと先と思いますが、癌に関しては今でも『早期発見』が最も治療に大切なことなので検査技術の進歩は期待が大きいですね。

仕分け「競争力低下招く」 科学予算削減に各学会が意見(朝日新聞) - goo ニュース
いんやぁ、どこの学会の偉いさん達も大変ですな。とくにこの件に関する柳田先生のブログのコメント欄なんかエライことになってますよ。僕としてはビッグプロジェクトを止めて、お金を我々下々に配ってくれたら嬉しいんだけど・・・この程度の無駄カットじゃ、95兆円のアホ予算に対しては焼け石に水。こっちに回ってくる期待も少ないですなぁ。
この国の科学技術に対する予算は先進国中下から2番目でして、トルコよりもちょっとましって程度です。そもそも日本は科学技術立国なんか目指してこなかったというのが実情でしょう。

本日のお酒:夢醸純米吟醸 限定無濾過
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贅沢だ

2009-11-19 23:42:49 | たわごと
この数日寒くなってきましたね。そろそろ『鰤起し』が鳴ってもいい頃だと思うのですが、海の幸が美味しくなってきたのは分かります。
寒さのせいか、ちょっと左ももの神経痛が痛いです。昨日1000メートル泳のうちの25メートルだけブレストストロークを入れたのがよくなかったのかな?平泳ぎって腰に悪いんですよ。クロールでの記録は好調時のものに近づいてきました。50メートルを37秒切れます。

うちの研究室の院生さんたちは寒がりさんばかりで、デスクワークをする部屋はもうガスストーブが絶賛フル稼働です。おかげで、空気が悪くて気持ちが悪いのなんのって。自宅で使ってるセラミックファンヒーターを持っていこうかと思っています。僕は自宅に暖房器具の一つや二つなくても過ごせますから。

さて、今日飲んだ第三のビールですが・・・贅沢?笑わしちゃいけない。がんばって造ったんだろうが、ビールで造ればもっと楽でいいものができただろうに。それに引き換え、夢醸の無濾過は柔らかで贅沢の極みですなぁ♪

本日のお酒:SUNTORY リキュール(発泡性) 琥珀の贅沢 + 夢醸純米吟醸 限定無濾過
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壊れても負けないっ!

2009-11-18 23:14:17 | たわごと
今日は復活したMacminiにMSOffice2008をインストールしました。ユーザーインターフェースがまた変わったんですね。こういう仕事に使うものは基本的に変えない方が親切だと思うのですが、そうはいかないんでしょうなぁ。より便利に変わるよりもそのままの方が便利ってことがあるんだよね。でも、Adobeの方が嫌がらせのように変えてくるんでMicroSoft(のMac部門)はまだましかも。
日本語変換ソフトを『ことえり』のままにするかどうかは検討中です。以前のことえりよりも雪ちゃんのことえりはずっと変換効率が向上しています。このままでもいいかも。エルゴソフトがEGBridgeの開発をやめた理由がわかります。でも、止めないでほしかったなぁ。10年以上バージョンアップについていきながら愛用してきましたから。元社員達によって設立された会社「物書堂」で後継ソフトウェア『かわせみ』が開発されて販売されています。これには興味津々♪ なんと1ユーザーたったの1995円。

今日、アイロンが壊れていました。先々週、小型の電気ストーブが壊れてたし・・・Macminiにヘルニアに・・・あちこち壊れてきてますなぁ。次は何かな?

本日のお酒:BUDWEISER
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ブラウザ問題

2009-11-17 23:09:28 | たわごと
新しくOS(Snowleopard:雪ちゃん)をインストールしたばかりなので、メインマシンMacminiはまだほとんど空っぽです。これまでやってきたことを徐々にやれるようにしていかなきゃなりません。まず自宅ではウェブブラウジングができて、メールのやり取りができること、そして、写真画像の処理とHTMLの編集ができることが最低限必要です。メールは最初からバンドルされているMailが動作したのでこれでOKです。前はまともに立ち上がらなかったので、MozillaのThunderbirdをメールソフトとして使ってました。ウェブブラウザSafariが当然のように快適に動いてますが、そもそもこいつはあまり好きではありません。そんなわけで今まで愛用していたMozillaのFirefoxをダウンロードしようとすると、このOSではちゃんと動きませんと雪ちゃんが警告してきてインストールさせてくれなんだ。昨夜はこれであきらめて就寝。今日はOpera10.01をダウンロード。このブラウザも世界で評価が高い。とにかく軽くて速いというふれこみ。これに期待してたんだが、使ってみるとさっぱり動作が遅くて使える代物じゃない。こりゃだめだ。次のバージョンに期待しましょう。とにかく更新のためにログインしようとしてもあまりの遅さにタイムアップしてできないんだから使えない。gooのブログでもblogspotのブログでもtwitterでもだめです。ただ、OperaでFirefoxをダウンロードしてみたらできたっ!!だめなOperaでもとりあえず役に立った。Firefoxが使える状態になればいいんですよ。Operaはこれで用なしです。
さて、クリーンインストールしたんで当然ブックマークはきれいさっぱり吹き飛んだままです。まずは記憶を辿って検索エンジンで今まで巡回していたサイトを探してブックマークしています。これはこれで整理整頓のためにとてもいい作業でして、見つけてもそのサイトの更新状態をみて登録するかどうか考え直すことができます。ろくに更新されないサイトを巡るのは時間の無駄です。な、ケンちゃん! それから、ぱっと思い出せないサイトはそもそも思い出す必要がないサイトな訳でして問題なしです。みたくなってから探せばよろしい。インターネットは情報の高速大量消費のための媒体なので、拘泥して探し出すようなもんではないのです。それだけの大切な情報なら印刷物でゲットすべきです。

ほかのソフトウエアはぼちぼちインストールしていく予定です。PhotoshopはElements6をインストールしました。いずれはフルバージョンのPhotoshopに移りたいんですけど、高価なのでいずれってことに・・・・。HTML編集はAdobeに見捨てられたGoLiveをやめてDreamweaverを買おうかと思っています。買う前に雪ちゃんで動作するかどうか確かめないといけませんな。

本日のお酒:立山純米大吟醸 雨晴 + 夢醸純米吟醸 限定無濾過
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クリーンインストール

2009-11-16 22:55:36 | たわごと
Macminiは入院確定だと判断していたのでリュックサックに入れて出勤しました。大学から発送しようと思ったんです。Appleのサイトで修理依頼のところを調べると金沢西インター通りに指定業者がいる。そこに電話するとクリーンインストールするしかないとのこと。いや、僕もそう思ってたんだけど、壊れてるMacにOSのディスクを食わすのは怖い。出せなくなるんじゃないか?!
相手のおっちゃんによると、そんときゃ店にもってこいとのこと。これで安心して、もう一度帰宅してモニターと接続させるためのケーブルとOSのディスクを持ってきた。MacminiはMini DisplayPort-VGAアダプタがないとVGAモニターとつながらないので大学生協で購入。こういう小物は生協に売ってる可能性がある。
モニターとキーボードをつないでoptionを押しながら起動。ジャーンと起動音がなったらディスクを差し込む。option+起動でMacは「どのディスクで起動するの?」と聞いてくるので、MacOSX10.5のインストールディスクを指定。立ち上がったらディスクユティリティを使って・・・・「すんません、ゼロからやり直します」を選択する。そしたら、ハードディスクはきれいさっぱりゼロになる。それからLeopardをインストールし、付属ソフトをインストールし、最新のバージョンにアップデート。ここでやめれば賢かったんだが、Snowleopardをインストール! ここで職場に館内放送が入ってセミナーがあるので聴きにこいとのこと。セミナーを終えて帰ってくるとモニターはPower Saving Modeになっていて真っ暗。セミナーまでは別のMacでデスクワークをしていてモニターが暗転したらすぐにマウスをクリックして叩き起こしたんだが、それを怠るとMacminiにつないだ古いモニターはもはや反応することはなく立ち上がらない。どうにもならないので、家に帰って自宅で使ってる19インチモニターを持ってきてつないだ。もちろん、インストール中の画面がちゃんと浮かび上がった。めんどくさいなぁ。とにかく、9時前にすべてのインストールが終わって、Macminiとモニターとキーボードを持って帰宅しました。長い一日だった。仕事はしてたよ。デスクワークをたっぷりとね♪
さて、帰宅して立ち上げるとiTunesが壊れてるとほざくので、AppleのサイトからiTunes9.0.2をダウンロード。この新しいiTunesはもちろん今までダウンロードしてきた音楽やiPhone用のソフトは入っていない。どうもこのままだと 空っぽのiTunesに同期されてiPhoneを空っぽにされてしまう。iPhoneを使ったソフトウエアの違法コピーを防ぐ仕組みのようだ。ソフトウエアを試しに同期してみるとすっかり消されてしまった。音楽はCDに焼いて保存できるのでここで消えてもかまわないが、ソフトは痛いなぁ。もう一つ困るのは住所録とSafari。これを同期してくれないのは迷惑。そもそもこれのコピーは誰にも迷惑をかけないはずなのにな。もう少し便利にしてくれないかなぁ。

本日のお酒:KIRIN 一番搾りとれたてホップ + 大分麦焼酎 いいちこ
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意外と充実した雨の日曜日

2009-11-15 20:53:36 | たわごと
昨夜、Macminiでトラブル発生。新OSをインストールした時に注意しなけりゃいけないことにHDに対するアクセス権があるのだけど、そこをいじっててコンピューターが立ち上がらなくなってしまった。さすがに立ち上がらないコンピューターに対してはやれることがないので、修理に出すことになりそうです。昨夜、起動させたまま寝てしまいました。その間、アップルマークが出てグルグル回ってる状態。午前3時過ぎにモソモソ起きてディスプレイの電源を切ってやっと安眠しました。そんなこんなで朝は絶不調。ディスプレイの電源を入れても立ち上がりきらずにグルグルグルグル・・・・。だめだ・・・。

今日も雨。南西強風♪ 昨日の仕事で出来たサンプルは凍結してあるので月曜日でOK。
てなわけで、獅子吼に行って講習会を受講。知ってる内容が中心ですが、繰り返しインプットすることが大事。知ってることを使えることに変換しておかなければなりませぬ。そのために繰り返しインプットする。これをもって『学習』といいます。これが出来るか出来ないかで後々の実践に違いが出る・・・かも。(笑)

さて、ツリーランした時に回収班としてのお願いは、「ハーネスを装着したまま木から降りずにそこにいてくれ」ということです。もちろん、シュリンゲ等を使って自己確保してて欲しいですが、できれば我々がたどり着くまで木から降りないで欲しい。ツリーランした状況では姿勢が不安定でそうしてるだけでつらいだけに、フライヤーは助けが来る前にさっさと木から降りちゃうことがある。フライヤーの安全な帰着とグライダーの回収までの作業を考えたら、人が来るまで木の上に残ってもらってた方が降りる時の安全に関しても回収作業の点でもよいのですよ。

講習会の後はOさん特製の美味しいカレー♪ 豆とひき肉のカレー。これがカレールーでなくてチリソースなら立派なチリスープ。メキシカン大好きメニューだ。セニョール達にもてもてでしょう。南半球で働く隊長についてって働いてもたぶんやっていけるよ。美味いメシ作れてタンデムフライトが出来るんだから鉄板だ♪ とっても美味しかったです。ありがとう。
獅子吼のクラブハウスでの話題のひとつが「ブルーレイに未来はあるのか」。HDMIで接続したフルハイビジョンのテレビで見ない限りブルーレイの画質の良さは楽しめないし、そもそもブルーレイではソフトが充実していない。DVDで十分に楽しめる。そんなこんな話を聞いたにも関わらず、買ってしまいましたSONYのBDレコーダー。これで地デジが見れます。以前は、アナログ地上波停波にあわせてテレビを見るのを止めようかと思ってたんですが、NHKが卑怯にも来年から『龍馬伝』を大河ドラマで流すんですよ。僕としてはこれは見なければなりません。出来の良し悪しに関わらずです。そんなわけで録画手段が必要で今年中に手段を何とかして得ておかないといけない。一時期は録画可能な液晶テレビを買おうかと思ったんですが、チューナー付きのデッキを買う方が経済的にまし。もちろん、DVDのみのデッキなら安いんだけど、それほどの値段差がないし、店頭に並んでる機種が少なすぎる。てなわけで、SONY BDレコーダーを買っちゃいました。ブルーレイディスクに未来があるかどうかはわかりません。でも、いいじゃん。欲しかったんだもん。まあ、最終的に買ったのはJoshinでちゃんと接客してくれる従業員がいたからですけどね。背中を押す人がいれば買っちゃう状況だったのです。笑
継続して使っているアナログAQUOSは十分働いてます。僕にとっては十分な画質だ。このころのシャープはいい製品を出していたんですな。

本日のお酒:立山純米大吟醸 雨晴
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治ってないけど大丈夫

2009-11-14 21:50:28 | PARAGLIDER
獅子吼にいると皆に訊かれます。「腰はもう良くなったんか?」って・・・・この夏に杖をついて左足を引きずってTDをしていた姿が印象的だったんでしょうね。心配かけて申し訳ないです。こうして声をかけてくれる方は圧倒的にシニアの方々。やはり、経験上これはたいへんだってことはご存知なんですね。僕は良くなったとも悪いとも答えられずにモゴモゴっとごまかして答えるのが精いっぱいなので、心苦しい気持ちでいます。
「ありがとうございます。完全に良くなってませんが、もう大丈夫です。」
と答えるのが正しいリアクションなんでしょうね。でも、スポーツやってる人間にとっては、そう答えるのも負けを認めるみたいで悔しいことなんです。(あほですなぁ)

左ももの筋肉にはまだ突っ張り感が残っていて、完全ではないんですが、普通に動かせます。腰に傷みはありません。走ることも階段を上ることも普通にできます。ただ、スポーツで競えるほどの回復はしていない。クロールで50メートル40秒切るのがやっと・・・。そんだけ泳げればいいだろうって? 昨年までは37秒切ってたんすよ。
今週MRI検査を受けたのですが、ヘルニアは引っ込んでいないが、圧迫されていた神経はずいぶん回復しているとのこと。筋肉の症状からいって納得です。そういうことなんでしょう。不安なので水泳はブレストを止めてクロールとバックだけ。今シーズンはスキーを控えめにしましょう。スノボは禁止です。雪山を歩くなんてもってのほかですな。パラはグライダーを担いで歩く負担が少ないならOKでしょう。飛んでしまえば、足はあんまり使いません。

んなわけでフライヤーの皆様、遠慮せずに僕と遊んでください♪

本日のお酒:大分麦焼酎 いいちこ
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手袋のサイズ

2009-11-13 22:18:34 | たわごと
仕事上、手術等に使われるラテックスグローブを良く使うのですが、今所属の研究室で僕だけがLサイズ。できるだけ節約しながら使ってるんだけどね・・・僕だけのためにLサイズを買ってもらうのは申し訳ないんだよなぁ。毎年男子学生が入るたびに手袋のサイズを聞くのだが、毎年裏切られる・・・どいつもこいつも、手がちっせぇよ。

福岡に住んでた頃の話だからもう10年以上前のこと。まあ、たまに一緒に飯を食う程度のつきあいだったんだが・・・。
博多を離れて金沢に行く前に餞別をくれた。あっちは寒いだろうということで・・・・九州人にとって金沢といったら、もうほとんどシベリアの真向かいで極寒の地だ。(苦笑)
自宅に戻って、きれいにラッピングされた袋を開けると手袋とマフラーのセット。手袋は男性のMサイズ。僕の手は入らなかった。すこし悲しかった。でも、すっきりした。未練も何もなくなった。

「あー、彼女は僕の手の大きさを知らなかった。こりゃ、だめだ。はははは。」

手袋はLサイズでお願いします!

本日のお酒:菊姫 鶴の里 + KIRIN CLASSIC LAGER
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新しいものにはリスクがある

2009-11-12 22:59:11 | たわごと
MacOSX 10.6 Snowleopard(略して『雪ちゃん』)、順調に動作しています。ユーザーインターフェース全般のデザインは好きじゃないんですが、OSの更新についていかないと後でエライ目にあうのがコンピュータの世界では常ですので、ここで追随しておくことにしました。三千円程度でアップグレードできるのなら安いものでしょう。
しかし、昨夜インストール途中でフリーズした時には絶望的な気分になりましたよ。いつもOSが新しくなってすぐにではなく、何ヶ月か待ってからOSをアップしてました。今まではいろいろな問題が噴出する様子を見てからアップしていたわけです。今回は安さに誘われそういった習慣をやぶって、新OSに飛びついたのが敗因です。結局フリーズしたMacminiの起動ボタンを長押しして強制終了し、再び起動する時に"option"ボタンを押しながら起動しました。それが良かったのかどうか分かりませんが、なんとまあ途中からインストールを再開してくれまして、インストールを完了できました。午後8時にインストールを初めてから午前0時をすぎてました。その間、ネットはiPhoneでしていたのです。昨日のエントリーもiPhoneからでした。

昨日飲んだ酒は、萬歳楽の新しい普通酒『愛』です。もちろん、今年の大河ドラマに影響されて造った銘柄でして、そのかわりに今まで出していた『匠』はなくなりました。女性にも飲みやすい造りにしたってことでしたが、ちょっと萬歳楽らしい口当りを捨てて丸くしてしまったような気がします。今日の『鶴の里』は菊姫がヨーロッパで賞を取った作品でさすがの出来です。これが普通酒だというところがすごいです。精米歩合がたったの65%なのに切れ味抜群の喉ごしです。兵庫県吉川町の山田錦100%の凄みですな。

本日のお酒:菊姫 鶴の里
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すいません

2009-11-11 23:57:52 | たわごと
MacにOSX10.6SnowLeopardインストール中で今日中に更新できませなんだ。

本日のお酒:萬歳楽 愛
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