撮影日：1997/08/02
撮影場所：出町柳駅 ※地図を表示
１９９７年３月のダイヤ改正時に登場しました。外観はブルーのラインが入っていること以外は、７２００系と全く同じです。しかし、客室は７２００系とは異なりセミクロスシートになっています。
撮影日：1997/12/25
撮影場所：樟葉駅 ※地図を表示
平日の朝のラッシュ時の特急用として登場しましたが、現在は昼間でも特急の３本に１本は９０００系になっています。
撮影日：1997/12/25
登場時には７２００系と同等の車内案内表示器が設置されていましたが、これも７２００系と同様に文字表示以外の部分は撤去されつつあります。
撮影日：1997/12/25
撮影場所：牧野－樟葉 ※地図を表示
８両編成のうち４両がロングシート化された編成もあります。
撮影日：1997/12/25
撮影場所：牧野－樟葉 ※地図を表示
９０００系はかなり中途半端で、昼間の特急としてはグレードが低く、ラッシュ時の特急としては収容人員が少ないです。
