厚みの薄い筐体を使う場合には

やはり、薄型でも大直径のファンを使用できるトップフローになりますね。

でも、コレで組むなら適応した排気も＠impress
http://pc.watch.impress.co.jp/docs/column/sebuncha/20141106_674697.html

考慮しておかないと、メモリの廃熱にも気を配る必要がありますね。
また、MicroATXのマザーを使っている場合、PCI-Ex16スロットに干渉して使えない場合があるのでマザーのレイアウトも良く考慮しましょう。

でも、割と低価格で冷却が望めるため、ビデオカードを搭載しない or PCI-Ex16スロットが複数有るマザーなんかで運用するには価格的にも選択肢に加えて良いでしょう。
代わりに、吸気や排気について気を配るか通気の良いケースにする必要がありますね。
逆に言うと、割と窒息気味なケースを多用する人にはむかないでしょう（＾＾；

え、自分ならどうかって？
厚みのある窒息気味の筐体で静粛性に気を配りつつ、前後に大きめのファンを付けるしか無いでしょうやはり。
必然的に、採用すべきクーラーはサイドフローかな。