【内閣府】沖縄科学技術研究基盤整備機構▽国民生活センター【総務省】情報通信研究機構【外務省】国際協力機構【財務省】酒類総合研究所▽日本万国博覧会記念機構
【文部科学省】大学入試センター▽国立科学博物館▽物質・材料研究機構▽国立美術館▽国立文化財機構▽科学技術振興機構▽日本学術振興会▽理化学研究所▽宇宙航空研究開発機構▽日本スポーツ振興センター▽日本学生支援機構▽海洋研究開発機構▽国立高等専門学校機構▽大学評価・学位授与機構▽国立大学財務・経営センター▽日本原子力研究開発機構
【厚生労働省】高齢・障害者雇用支援機構▽福祉医療機構▽労働政策研究・研修機構▽労働者健康福祉機構▽国立病院機構▽医薬品医療機器総合機構▽医薬基盤研究所▽年金積立金管理運用独立行政法人
【農林水産省】農林水産消費安全技術センター▽家畜改良センター▽水産大学校▽農業・食品産業技術総合研究機構▽水産総合研究センター▽農畜産業振興機構▽農林漁業信用基金
【経済産業省】製品評価技術基盤機構▽新エネルギー・産業技術総合開発機構▽日本貿易振興機構▽情報処理推進機構▽石油天然ガス・金属鉱物資源機構▽中小企業基盤整備機構
【国土交通省】建築研究所▽航空大学校▽鉄道建設・運輸施設整備支援機構▽国際観光振興機構▽水資源機構▽自動車事故対策機構▽海上災害防止センター▽都市再生機構▽住宅金融支援機構
【環境省】環境再生保全機構【防衛省】駐留軍等労働者労務管理機構
（2010年4月8日22時17分 読売新聞）
去年の「仕分け」で、（スーパーコンピューター開発予算）「（コンピューター性能で）世界一を目指す理由は何か。２位ではだめなのか」とケロッと言ってのけた蓮舫仕分け人は、素人以下でした。それでもまた蓮舫氏なのか。
「事業仕分け」それ以前の問題として、そもそも「仕分け人」らが国家予算の行方に関われるほどの能力があるのか？（これは鳩山政権全体にいえる本質的大問題だが） 前回の仕分けで、つくづく”仕分けショー”が抱える根本的大問題もよくわかった。彼らの能力いかんで国に何が起こるかわかったものではないということ。
どうしてもというなら、仕分け人の言動など能力も一緒にチェックという意味で、これら独立行政法人が”仕分け対象”に上がった理由や資料など、判断材料は国民にも事前公開されるべきでしょう。
