統計のコツのこつ(19)

このブログは「すぐに役立つ統計のコツ」(オーム社)で書き足らなかった事柄を書いています。
今回は、「クラスター分析」のいくつかの方法をデータ解析環境「R」を使ってご紹介します。

それでは、「すぐに役立つ統計のコツ」第７章(117ページ)を開いて下さい。

 

本書の「例題 20」(表7.24)は情報統計研究所(HP)の「著書の正誤表と例題」の[Excel Samples]をクリックし、[Excel Sample(2)]をダウンロードして下さい。

[Excel_Sample(2).xlsx](Sheet名：表7.25)の「A1～E7」を「選択→コピー」し「R」に
取り込んで下さい。要領は統計のコツのこつ(16)と同じです。

 

それでは［Ｒ］を立ち上げて下記のコマンドを実行して下さい。

 

***
dat<- read.delim("clipboard", header=T)
head(dat) 

　# ２種類のデンドログラム(樹形図)の作成
　# ユークリッド距離（complete：完全連結法とか最遠隣法と言う） 

plot(hclust(dist(dat, "euclidean"), "complete"), hang=-1)

　# ユークリッド距離（Ward法：ウォード法とか最小分散法とも言う）

plot(hclust(dist(dat, "euclidean"), "ward.D"), hang=-1)

 

出力結果：

 

図１：最遠隣法

 

 

図２：ウォード法

 

その他の方法を実行される場合は、次の様な引数を使って下さい。

 

単連結法（最近隣法）：single
群平均法     ：verage
重心法　     ：centroid
メディアン法     ：median
McQuitty法     ：mequitty

 

クラスター分析の実例として、情報統計研究所(http://kstat.sakura.ne.jp/index003_2.htm)を参考にして下さい。

 

図３：学力考査のデンドログラム(一例)

 

 

図４：民力指標のデンドログラム(一例)

 

次も引き続き「多変量解析(主成分分析、124ページ)」のお話です。

 

情報統計研究所はここから