二つのエクセルファイルを普通にクリックして開くと、一つのエクセルウィンドウに二つのファイルが開いてしまいます。
一つのウィンドウ内で自動で整列させたいときはこれでよいのですが、モニター画面を二つ使っているときなど、別ウインドウで開いて自由に大きさを配置して操作したいときには少し面倒です。
そういう時には、二つ目のファイルを開くときに、ファイルをダブルクリックするのではなく、スタートメニューなどからもうひとつエクセル本体を起動させて新たにできたエクセルウィンドウにファイルをドラッグアンドドロップすればOKです。ちょっと面倒なので、二つのファイルを比較しながら操作したい時だけそのようにしています。