分子生物学との出会いその２

私は最初、ＰＣＲの原理もたいしてわからない状態で予研に行きました。そうしたら、こんな例題を出されたんです。

1ng/ul(ナノグラム/マイクロリットル)のプラスミドがあります。
プラスミドのサイズは１４．９Ｋｂ（キロベース）。
1ul中に何コピーあるか計算しなさい。

ＰＣＲの陽性コントロールとして、あるウイルスの全長を組み込んだプラスミドを使うことになっていました。ウイルスを定量するため、このプラスミドを使って標準曲線を得ようというわけです。つまり、１コピー、１０コピー、１００コピー、という具合に希釈をしたかったのですね。

この計算はアボガドロ数を知らないとできません。１モル中に6.02x10の6乗コピーあるという計算です。また、１ヌクレオチドの分子量も必要です。ここでは３３０としました。二本鎖であることも忘れてはいけません。もし興味があれば計算してみて下さい。答えは6.1x10の７乗コピーです。

その時は必死でやってましたが、後で考えると「ウイルスのＤＮＡをプラスミドに組み込むってどうやるんだろう？」まったくわかりませんでした。最低限の技術は習いましたので、さっそく自分の研究所で同じような実験を組むことは可能でした。でも、そのままやればなにか失敗しても解決できない。陽性コントロールはいつも誰かにもらわなきゃならない。自分で全部管理できるようにするにはどうしたらいいかと考えました。そこで、最初に予研に行くようにと言った上司にお願いして、阪大でさらに分子生物学の勉強させてもらうことになりました。そのことが後々の私の仕事を決定づけたのです。

本当にゼロから始めましたから、どこから手をつけていいかわからないほどでした。実験をやりながら、同時並行で本を読んで勉強しました。実際に手を動かしていなかったら、とうてい読めなかったと思います。そのときから後々まで、繰り返し読んだのが「ワトソン遺伝子の分子生物学」です。これから勉強する人にもお勧めします。