Scott A. Armstrong, Jane E. Staunton, Lewis B. Silverman, Rob Pieters, Monique L. den Boer, Mark D. Minden, Stephen E. Sallan, Eric S. Lander, Todd R. Golub & Stanley J. Korsmeyer
MLL translocations specify a distinct gene expression profile that distinguishes a unique leukemia
Nature Genetics 30, 41-47 (2001)
[
PDF][
Web Site]
・遺伝子発現プロファイルによる白血病の診断。ALL、MML、AMLの三種。
・データ:白血病、57サンプル [20 ALL, 17 MLL, 20 AML]、約12600遺伝子
・遺伝子ランキング法:Signal-to-noise statistic → (μ
0 - μ
1)/(σ
0 + σ
1) μ:median, σ:SD
・クラス分け法(Class predictor):k-nearest-neighbors
・「
To our knowledge, this is the first whole-genome profiling study to show that a chromosomal translocation can specify a unique gene expression program.」
・白血病の細かい分類に関する議論についていけない。生物学・医学寄りの内容。