「日本文学Ｗｅｂ図書館」関係者の方から、５／１９のブログにコメントをいただきました。大変ありがとうございました。
ＮＯＴ検索は、修正プログラムを近々アップするとのことです。
部分一致は参照機能限定なのかと誤解してましたが、「句検索」の際に使えることがわかりました。どおりで、国際日本文化研究センターの和歌データベースのヒット件数より少なかったわけです。
デフォルトで前方一致に設定されている「句検索」を、部分一致に変更する手順は、以下のとおり。
●入力欄に検索文字を入力する→ポイントをあて右クリックする→部分一致ほかの検索情報が出る→その中から選択する
ちなみに、選択肢は、部分一致・前方一致・後方一致・完全一致です。
私は特定の植物名を含む和歌を検索することが多いので、デフォルトで部分一致だとありがたいかな。（ひるがえって前述の和歌データベースは、前方一致・後方一致の設定ができなかったのだと、今さらながら知りました。）