Tavazoie S, Hughes JD, Campbell MJ, Cho RJ, Church GM.
Systematic determination of genetic network architecture.
Nat Genet. 1999 Jul;22(3):281-5.
[PDF][Web Site]
・Yeast遺伝子のクラスタリングによる遺伝子機能・ネットワークの推定。
・データ:Yeast、6220遺伝子、時間点15点(Cell cycle 2周期分)、Affy.[Cho]
・クラスタリング法:k-means algorithm(SYSTAT 7.0(SPSS))、k=30
・Motif検索(AligenACE)
・結果「Most clusters have non-periodic temporal profiles, with some showing complex behaviour.」
・まとめ「The combination of experimental and computational approaches presented here, together with experimental verification of novel motifs and the discovery of their trans-acting factors, should allow the construction of the circuit diagram for the genetic network, allowing us to both understand and manipulate complex cellular processes on a system level.」
・クラスタリング結果をMotifの点から見ているところが目新しい。その後すたれてしまったのだろうか。
Systematic determination of genetic network architecture.
Nat Genet. 1999 Jul;22(3):281-5.
[PDF][Web Site]
・Yeast遺伝子のクラスタリングによる遺伝子機能・ネットワークの推定。
・データ:Yeast、6220遺伝子、時間点15点(Cell cycle 2周期分)、Affy.[Cho]
・クラスタリング法:k-means algorithm(SYSTAT 7.0(SPSS))、k=30
・Motif検索(AligenACE)
・結果「Most clusters have non-periodic temporal profiles, with some showing complex behaviour.」
・まとめ「The combination of experimental and computational approaches presented here, together with experimental verification of novel motifs and the discovery of their trans-acting factors, should allow the construction of the circuit diagram for the genetic network, allowing us to both understand and manipulate complex cellular processes on a system level.」
・クラスタリング結果をMotifの点から見ているところが目新しい。その後すたれてしまったのだろうか。