ぴかりんの頭の中味

主に食べ歩きの記録。北海道室蘭市在住。

2006年06月20日 22時31分10秒 | 日記2005-10
ようやく夜でも窓を閉めなくてよい季節になった。
本を読んでいると、車の通る音に混じって耳障りな鳴き声が。
『カエル!!?』
意識するともう聞こえない。


田舎ではあるけれども、さすがにカエルは…
空耳か。
コメント (2)
  • X
  • Facebookでシェアする
  • はてなブックマークに追加する
  • LINEでシェアする

【論】Michaels,1998,Cluster analysis and data ~

2006年06月20日 19時42分08秒 | 論文記録
George S.Michaels, Daniel B.Carr, Manor Askenazi, Stefanie Fuhrman, Xiling Wen, Roland Somogyi
Cluster analysis and data visualization of large-scale gene expression data.
Pac Symp Biocomput. 1998;:42-53.
[PDFダウンロード][Webサイト]

・大量の時系列マイクロアレイデータをうまく図示することにより、遺伝子間の相互関係(ネットワーク)を推定する。
・データ:ヒト、cDNA、112遺伝子、時間点9点。
・クラスタリング指標(2種) 
1.Euclidean distance measure
2.Normalized mutual information

・目的「A goal of this work is to determine whether genes within these categories exhibit overlapping mRNA expression trajectories or control patterns.

・マイクロアレイ関連としては、初期の論文。アレイデータをどう図示するか、まだ手探り状態。
コメント
  • X
  • Facebookでシェアする
  • はてなブックマークに追加する
  • LINEでシェアする