George S.Michaels, Daniel B.Carr, Manor Askenazi, Stefanie Fuhrman, Xiling Wen, Roland Somogyi
Cluster analysis and data visualization of large-scale gene expression data.
Pac Symp Biocomput. 1998;:42-53.
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・大量の時系列マイクロアレイデータをうまく図示することにより、遺伝子間の相互関係(ネットワーク)を推定する。
・データ:ヒト、cDNA、112遺伝子、時間点9点。
・クラスタリング指標(2種)
1.Euclidean distance measure
2.Normalized mutual information
・目的「
A goal of this work is to determine whether genes within these categories exhibit overlapping mRNA expression trajectories or control patterns.」
・マイクロアレイ関連としては、初期の論文。アレイデータをどう図示するか、まだ手探り状態。