ぴかりんの頭の中味

主に食べ歩きの記録。北海道室蘭市在住。

明日、結婚式。

2007年05月26日 23時05分18秒 | 日記2005-10
なんて書くと、ビックリドッキリされる方いらっしゃいますかねぇ…
 明日は大学オケ後輩(同士)の結婚式です。一曲弾くハメになってしまいました。(ほぼ)カルテットで、軽~くさらっとアイネク全楽章を……

 重い…重すぎる…

どうなることやら、御臨席の方々には、ご歓談に専念していただくことを祈るのみです。
 本日は夕方から時折激しい雨。明日は晴れますように。

 なんかお腹が空くと思ったら、晩御飯たべるの忘れてた…ボケてるボケてる。

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【論】Sangurdekar,2006,A classification based frame~

2007年05月26日 18時49分58秒 | 論文記録
Dipen P Sangurdekar, Friedrich Srienc and Arkady B Khodursky
A classification based framework for quantitative description of large-scale microarray data
Genome Biology 2006, 7:R32
[PDF][Web Site]

・遺伝子クラス分け法(Entropy reduction)の提案。
・データ:Escherichia coli (大腸菌)、30種以上の環境(薬品投与[濃度変化]・物理刺激[時間変化])
・比較したクラス分け法:k-means clustering, hierarchical clustering, signature algorithm (SA)

・概要「In this study, we propose a novel method based on a condition-specific entropy reduction of functional groups to determine well-defined physiological responses to diverse experimental treatments.

・実験の設定も、識別アルゴリズムもなんだかよくわからず。Shannon entporyを指標に発現量データのエントロピーが小さくなるような組み合わせの遺伝子集団を抽出する?
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