ぴかりんの頭の中味

主に食べ歩きの記録。北海道室蘭市在住。

【論】Ross,2000,Systematic variation in gene express~

2007年04月25日 20時22分45秒 | 論文記録
Douglas T. Ross, Uwe Scherf, Michael B. Eisen, Charles M. Perou, Christian Rees, Paul Spellman, Vishwanath Iyer, Stefanie S. Jeffrey, Matt Van de Rijn, Mark Waltham, Alexander Pergamenschikov, Jeffrey C.F. Lee, Deval Lashkari, Dari Shalon, Timothy G. Myers, John N. Weinstein, David Botstein & Patrick O. Brown
Systematic variation in gene expression patterns in human cancer cell lines
Nature Genetics 24, 227-235 (2000)
[PDF][Web Site]

・ヒトのガンに関する組織について、多数のサンプルにより網羅的に解析した。現在、『NCI60』と呼ばれ、テストデータとして広く用いられているデータの元になった論文。
・データ:ヒト、60サンプル(内訳:acute myeloid leukaemia, chronic myeloid leukaemia, non-small-cell-lung, colon, central nervous system, melanoma, ovarian, renal, prostate, breast)、約8000遺伝子、cDNA
・サンプルと遺伝子のクラス分け法:Hierarchical clustering (Pearson correlaton coefficient), Average linkage clustering
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