南米の連邦軍基地ジャブローで補給と整備を終えたホワイトベースは、再び宇宙へと飛び立った。宇宙での反攻作戦に出立するティアンム艦隊の囮としてである。シャア・アズナブル率いる機動巡洋艦ザンジバルはホワイトベースを追うが、ニュータイプとして覚醒したアムロは行く手に立ちふさがるドレンのムサイ艦隊を撃破して包囲網を突破すると、中立コロニーであるサイド６に入港して追っ手をかわそうとするのだが……。
宇宙での艦隊戦がメインとなる最終章です。
ほぼテレビ版のまとめだった１作目、テレビ版には登場しなかったコアブースターと作画のひどかったセイラさん周りを新たに描き起こした２作目に対して、７割以上新作映像の３作目はテレビ版で見たかったシーンの連続でした。
もう１人のニュータイプであるララァ・スンあたりはもはやどうでもよく（よくないけど）、冒頭の軌道上での艦隊戦からクライマックスの宇宙要塞ア・バオア・クーまで、ノーマルザクの指揮官型やらゲルググ量産型など今まで登場したモビルスーツが続々登場します。けれど、個人的には"巨大ロボット"に乗れない一般兵の視点で、ガトルやジッコ、さらにはボールなどのいかにも棺桶っぽい機体に総力戦というか末期戦というか、あれこれ感じてわくわくしていたのです。自分が乗せられるならこっちだなと。
最近のガンダムものだと比較対象である通常の兵器っぽいカテゴリのメカが少なくて寂しいですね。あの、作業艇とかをやっつけ仕事で戦えるようにしました！感がいいんだよ？
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