前述のようにモーガンは2000人（1500人説あり）の海賊を率いてサン・ロレンソ砦を出発、チャグレス河に沿ってパナマ市に９日目に到達しました。迎え撃つ守備隊も2000人でしたが、一日の戦いで敗北しました。そしてパナマ市は完全に破壊、略奪されました。
このときの海賊たちの収穫？についてはいろいろ説があるようですが、最後は分け前が少ないと騒ぎ出し、モーガンは一人逃げ出し海賊業から足を洗いイングランドに帰り宮廷に取り入りサーの称号をもらいジャマイカの副総督に任命され海賊の処刑に精を出すことになります。
このときの破壊でこのパナマ市は回復不能になり廃墟のまま放擲され現在のパナマ市はここから太平洋沿い西に10ｋｍのところに再建されました。この廃墟になった旧パナマ市は現在パナマビエホと呼ばれ遺跡公園として観光地になっています。
写真はパナマビエホに残る教会です。
バッカニアの略奪品の分配について増田義郎の「略奪の海カリブ」を紹介しておきます。
「略奪品の分配は、負傷者を優先した。右腕を失った者は８レアル銀貨600枚ないしは奴隷6人、左腕または右脚を失った者は500枚ないしは奴隷5人、左脚を失った者は400枚ないしは奴隷4人、片眼失明したものと指1本失った者は100枚か奴隷一人。残りが傷を負わなかった者全員に分配されるのだが、船長は普通の船員の5倍から6倍の分け前を取った」（ｐ123）
なお、このモーガンのパナマ略奪、破壊についてはスタインベックが処女作「黄金の杯」で小説化しているそうです
